Wellcome Sanger Institute、Parse Biosciences 與 Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 今日宣布建立合作，致力于構(gòu)建單細(xì)胞圖譜基礎(chǔ)項目，重點(diǎn)研究癌癥治療反應(yīng)中的可塑性機(jī)制。該合作將為后續(xù)開發(fā)涵蓋數(shù)億細(xì)胞的癌癥可塑性圖譜奠定基礎(chǔ)。
通過創(chuàng)新的類器官擾動模型和人工智能（AI）平臺，該項目旨在創(chuàng)建一個全面的數(shù)據(jù)集，為基礎(chǔ)藥物發(fā)現(xiàn)模型和癌癥研究提供支持。
Sanger Institute 團(tuán)隊負(fù)責(zé)人 Mathew Garnett 博士和 Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 主任、Sanger Institute 副教授 Fabian Theis 將擔(dān)任此次合作的首席研究員。
Garnett 的研究團(tuán)隊開發(fā)出新型的 3D 類器官培養(yǎng)模型，作為高度可擴(kuò)展、功能強(qiáng)大的癌癥模型，可捕捉患者腫瘤的典型特征。該團(tuán)隊將使用大量類器官——即培養(yǎng)皿中的微型腫瘤——作為模型，以更深入探究癌癥在治療下的可塑性與適應(yīng)機(jī)制。
Theis 的團(tuán)隊因在 AI 與單細(xì)胞基因組學(xué)交叉領(lǐng)域開創(chuàng)計算算法來解決復(fù)雜生物學(xué)挑戰(zhàn)而廣受認(rèn)可，特別在藥物對細(xì)胞系統(tǒng)影響的計算機(jī)建模方面表現(xiàn)出色。該項目將在 Parse Biosciences 的 GigaLab 實(shí)驗室中展開，這是一個專為高速生成大規(guī)模單細(xì)胞 RNA 測序數(shù)據(jù)而設(shè)計的先進(jìn)設(shè)施。
Sanger、Helmholtz Munich 和 Parse 團(tuán)隊已開發(fā)出自動化方法來簡化實(shí)驗室程序，以及分析和發(fā)現(xiàn)此類規(guī)模數(shù)據(jù)集中洞察所需的計算方法。
該合作的最終目標(biāo)是構(gòu)建一個單細(xì)胞參考圖譜，實(shí)現(xiàn)虛擬細(xì)胞建模，進(jìn)而預(yù)測抗癌藥物效果——包括哪些藥物可能導(dǎo)致耐藥、何時產(chǎn)生耐藥性、以及未來治療應(yīng)該如何靶向等。
Wellcome Sanger Institute 團(tuán)隊負(fù)責(zé)人兼項目聯(lián)合負(fù)責(zé)人 Garnett 博士表示：“我們已經(jīng)開發(fā)出一個變革性平臺，能夠?qū)崿F(xiàn)大規(guī)模類器官篩選以及下游數(shù)據(jù)生成和分析，有望重新定義對癌癥治療反應(yīng)的理解。我們將組建匯集學(xué)術(shù)與產(chǎn)業(yè)界頂尖專家的協(xié)作社區(qū)，推動項目發(fā)展。這種規(guī)模的研究對于開發(fā)基礎(chǔ)模型至關(guān)重要，有助于推動該領(lǐng)域的實(shí)質(zhì)性進(jìn)展�！�
項目聯(lián)合負(fù)責(zé)人、Helmholtz Munich 的 Computational Health Center 主任 Theis 指出：“隨著 AI 技術(shù)進(jìn)步，虛擬細(xì)胞擾動模型的構(gòu)想正逐步成為現(xiàn)實(shí)——但要實(shí)現(xiàn)規(guī)模效應(yīng)，我們需要大量高質(zhì)量的單細(xì)胞擾動數(shù)據(jù)集。這次合作提供了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的路徑，我期待在藥物發(fā)現(xiàn)中實(shí)現(xiàn) AI 驅(qū)動的實(shí)驗設(shè)計�！�
Parse Biosciences 的首席技術(shù)官 Charlie Roco 博士表示：“我們非常高興能將 GigaLab 的強(qiáng)大功能帶給這些具有前瞻性的合作伙伴。借助 Parse 自主研發(fā)的 Evercode 化學(xué)平臺，GigaLab 能快速生成大規(guī)模高質(zhì)量的單細(xì)胞數(shù)據(jù)集。此次與 Wellcome Sanger Institute 和 Helmholtz Munich 合作，將科研實(shí)力與 GigaLab 的規(guī)模與速度結(jié)合起來，為從根本上改變我們對癌癥的理解提供了機(jī)會�！�
關(guān)于Parse Biosciences
Parse Biosciences是一家全球性的生命科學(xué)公司，以為人類健康和科學(xué)研究提速為使命。公司讓研究人員能夠以前所未有的規(guī)模和便利進(jìn)行單細(xì)胞測序，借助創(chuàng)新性的實(shí)驗方法在癌癥治療、組織修復(fù)、干細(xì)胞治療、腎臟和肝臟疾病、大腦發(fā)育和免疫系統(tǒng)領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)了突破性的進(jìn)展。
Parse Biosciences 由 Alex Rosenberg 和 Charles Roco 于華盛頓大學(xué)共同創(chuàng)立，至今已籌集超過 1 億美元資金，全球已有 2500 多家客戶使用其產(chǎn)品。其產(chǎn)品組合包括： Evercode™ Whole Transcriptome、Evercode™ TCR、Evercode™ BCR、Gene Select 以及數(shù)據(jù)分析解決方案 Trailmaker™。
Parse Biosciences總部位于西雅圖充滿活力的 South Lake Union區(qū)，最近那里已擴(kuò)建為一個全新的總部和最先進(jìn)的實(shí)驗室。
關(guān)于 Helmholtz Munich
Helmholtz Munich 是全球領(lǐng)先的生物醫(yī)學(xué)研究中心，其使命是在快速變化的世界中開發(fā)突破性的健康解決方案。該跨學(xué)科研究團(tuán)隊主要專注于環(huán)境誘發(fā)疾病，特別是糖尿病、肥胖、過敏和慢性肺部疾病的治療和預(yù)防。借助人工智能與生物工程技術(shù)，研究人員正加速科研成果向臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化。Helmholtz Munich 擁有約 2500 名員工，總部位于慕尼黑的諾伊爾貝格。它是 Helmholtz Association 的成員，該協(xié)會擁有超過43000名員工和18個研究中心，是德國最大的科學(xué)組織。
關(guān)于 Wellcome Sanger Institute
Wellcome Sanger Institute 是全球領(lǐng)先的基因組學(xué)研究中心，專注于開展大規(guī)模研究，構(gòu)建生物學(xué)與醫(yī)學(xué)知識的基礎(chǔ)。我們秉持開放與協(xié)作的精神，將數(shù)據(jù)、成果、工具與技術(shù)在全球范圍內(nèi)共享，以推進(jìn)科學(xué)發(fā)展。我們的目標(biāo)雄心勃勃——致力于推進(jìn)其他機(jī)構(gòu)難以承擔(dān)的項目。在 Wellcome 的資助下，我們擁有拓展基因組學(xué)前沿的自由和支持力量，研究成果廣泛應(yīng)用于改善人類健康和認(rèn)知地球生命。
關(guān)于 Wellcome
Wellcome 致力于通過科學(xué)解決全球緊迫的健康挑戰(zhàn)。我們支持關(guān)于生命、健康與福祉的研究，并聚焦于三大全球性健康議題：心理健康、傳染病與氣候與健康。
